软件著作权申请费用包括登记费、服务费等，具体金额有明确规定。

分析：软件著作权的申请费用主要包括登记申请费、例外交存手续费、权利转移备案费、续展费、证书费、变更或补充登记费、异议请求费、复审请求费、源程序封存保管费以及延期处理费等。这些费用根据《计算机软件保护条例》及其实施细则，由国家版权局或相关机构制定并公布，具有明确的计算方式和标准。

提醒：若申请过程中遇到费用异常增加或不明确的情况，可能表明存在问题，应及时咨询专业人士以避免不必要的损失。
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具体操作：

1. 登记申请费：根据软件及其文档的数量，按照每件250元的标准计算，每增加一种文档增收80元。
2. 例外交存手续费：若需要例外交存服务，每件需支付320元。
3. 权利转移备案费：根据转让或许可、继承等不同情况，分别按照每件300元或200元的标准计算。
4. 其他费用：续展费、证书费、变更或补充登记费、异议请求费、复审请求费等均按照官方公布的标准进行计算。
5. 源程序封存保管费：根据源程序的页数，100页内每页120元，超过100页的，每增加一页增收2元。
6. 延期处理费：首次申请每件需支付100元，再次申请则需支付200元。

在申请过程中，应确保费用的准确计算和及时缴纳，以避免影响申请的顺利进行。
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处理方式：软件著作权申请费用的处理主要包括自行计算和咨询专业机构两种方式。

选择建议：若对软件著作权申请流程和相关费用有深入了解，可自行根据官方公布的标准进行计算；若不熟悉相关流程或费用标准，建议咨询专业的知识产权代理机构或律师，以确保申请过程的顺利进行。