护照被出入境管理局扣押，通常涉及违法犯罪或护照异常。

从法律角度看，出入境管理局扣押护照的权利来源于《中华人民共和国居民身份证法》及其他相关法律法规。扣押护照的具体情形可能包括但不限于护照持有人涉嫌违法犯罪、护照存在伪造或变造嫌疑、护照持有人未按照规定办理出入境手续等。这些措施旨在保护国家安全和社会公共利益，确保案件的顺利调查和审理。

如果护照被长时间扣押，且未得到明确解释或处理，可能表明问题比较严重。此时，应及时寻求专业人士的帮助，了解扣押原因并维护自己的合法权益。
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从法律角度看，护照被扣押的常见处理方式包括申请行政复议或提起行政诉讼。

选择不同处理方式时，应考虑个人情况、扣押原因及法律后果。如果认为扣押行为存在违法或不当之处，且希望通过法律途径解决争议，可以选择行政复议或行政诉讼。行政复议相对快捷，而行政诉讼则更具法律效力。
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从法律角度，护照被扣押在不同情况下的处理方式如下：

1. 如果认为扣押行为违法或不当，可以向扣押机关提出异议，并要求其说明扣押理由和依据。扣押机关应当出示执法证件，并告知当事人扣押护照的理由和依据。
2. 如果异议未得到妥善处理，可以依法申请行政复议。行政复议期间，行政机关认为需要停止执行扣押决定的，可以停止执行。
3. 如果行政复议结果仍不满意，可以向人民法院提起行政诉讼。法院将依法审理案件，并作出判决。在诉讼过程中，当事人有权依法进行辩论、质证等。

在处理护照扣押问题时，务必保持冷静、理性，依法维护自己的合法权益。