公司账户被司法冻结后，除了等待三个月期满自动解冻外，还可以通过法律途径主动申请解冻。根据《民事诉讼法》的相关规定，企业需向法院提出申请，并请求法院出具解冻通知书或相关证明以解冻账户。若冻结期满前未申请继续冻结，冻结将自动解除。因此，企业应及时关注冻结期限，并在必要时向法院提出解冻申请。
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若公司账户被错误冻结，应首先收集相关证据，证明账户资金与案件无关。然后，向冻结账户的法院提出申请，要求解冻账户。法院在审查相关证据后，若认为冻结确有错误，会依法出具解冻通知书或相关证明，以尽快解冻账户。
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从法律角度，公司账户被司法冻结期间，企业应注意以下事项：一是及时关注冻结期限，避免错过自动解冻或申请继续冻结的时限；二是积极与法院沟通，了解冻结原因及解冻流程；三是妥善保管账户资金及交易记录，以备解冻时证明账户资金合法性；四是若账户被错误冻结，应及时收集证据并申请解冻。