合管办丢失住院报销药费单和发票，应依法报告并寻求替代证明。分析说明：从法律角度看，发票的丢失需及时向税务机关报告，并在指定媒介上公告作废。若医院不重新开证明，可依据《中华人民共和国发票管理办法》的相关规定，要求医院提供发票存根联复印件并加盖公章，或获取医保部门出具的丢失医疗费用票据核对证明，以此作为报销的替代证明。提醒：若发票丢失导致无法报销，且医院和合管办均不配合处理，表明问题较为严重，应及时寻求法律途径解决。
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处理方式：从法律角度，处理此类问题的常见方式包括：1.向税务机关报告并公告作废：确保税务部门了解发票丢失情况，防止被恶意使用。2.协商医院提供替代证明：如发票存根联复印件、医疗费用票据核对证明等。3.寻求医保部门协助：医保部门可根据规定对符合报销范围的医疗费用进行结算。选择方式建议：根据具体情况选择最适合的处理方式。若医院不配合，可优先考虑向医保部门寻求协助，再考虑通过法律途径解决。
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具体操作：从法律角度，针对不同情况，处理方式如下：1.若发票丢失后未及时发现，应立即向主管税务机关书面报告，并在税务机关指定的报刊等媒介上刊登公告声明作废。2.若医院不重新开具证明，可协商医院提供原始收费票据存根联的复印件，并加盖医院财务专用章，或获取《基本医疗保险参保人员丢失医疗费用票据核对证明》。3.在获取替代证明后，持相关材料（如医疗费用证明材料、处方底方、费用明细清单等）到医保部门进行申报，由医保部门进行核查与审核。4.若医保部门审核通过，可按照相关规定进行医疗费用报销。若审核不通过或医院、合管办均不配合处理，可考虑通过法律途径维护自身权益。请注意，在处理过程中应保留好所有相关证据和材料，以便在需要时提供证明。